如上图示,经LeviCellTM一步简便处理后,可将4个样本(人输尿管、人终板、人髓核1、人髓核2)的细胞活率由83.9%、56.0%、78.0%和89.0%分别提升至96.0%、98.6%、93.4%和94.9%;碎片率由60.0%、37.0%、26.0%和34.0%下降至4.0%、5.7%、9.0%和7.0%;结团率由20.1%、23.0%、34.0%和40.0%降低至26.2%、18.9%、10.1%和25.8%。从而,全面提升样本质量,为下游获取高质量单细胞测序数据打下夯实的基础。
除细胞计数仪的间接检测结果外,利用LeviCellTM内置的显微成像系统,还可直接通过肉眼观测到细胞样本质量提升的整个过程。如下图所示:
下机数据-细胞过滤
高线粒体表达量意味着细胞破损,或者非正常细胞。不同组织不进行富集处理的情况下,其线粒体基因所占的比例均在10%-20%左右,甚至有一些组织的线粒体基因占比要高于20%。而引入LeviCellTM系统之后,结果发现其线粒体占比迅速下降,达到5%及以下,保证了细胞的质量。
下机数据-细胞数及中位基因数统计
人输尿管检测到细胞数10,097,每个细胞的平均基因中位数2,106。人终板检测到细胞数4,119,每个细胞的平均基因中位数3,371。人髓核1检测到细胞数1,633,每个细胞的平均基因中位数4,178。人髓核2检测到细胞数3,837,每个细胞的平均基因中位数4,276。所有样本检测到的细胞数和每个细胞的基因中位数均符合预期。
经过以上抽取的随机样本处理结果,LeviCellTM系统提供了一种单细胞分析前的样本处理方案,只需一步简便的操作,便可有效去除死细胞及碎片,为下游提供值得信赖的高质量实验数据。LeviCellTM的引入,亦是贝瑞基因向客户阐释“成为值得信赖的基因科技公司”愿景所迈出的坚定一步。
摘自网址:http://www.360zhyx.com/home-research-index-rid-79955.shtml